Чар-: чары, очаровать. Возможно, родственное слово - кары (в первоначальном смысле - "козни", "колдовство")?
Чар(к)-: чарка.
Час-: час, часовой. Видимо, вариант корня кус- [?].
Част-/чащ-: часто, чаща.
Част-: часть, частный. Возможно, корень связан с корнями в словах кусать и кость.
Чах-: чахнуть, чахлый. Родственно ли слову скука?
Чел-: чело, человек.
Челюс-: челюсть.
Чер(в)-: червь; червоный.
Черед-/черёд-: чередовать, очередь, черёд. Возможна связь с через- [?].
Через- (чрез-): предлог и приставка через. Возможна связь с черед- [?].
Черен-: черенок.
Череп-: череп, черепаха.
Чёрм-: чёрмный.
Черн-/чёрн-: чёрный, чернить.
Черп-: черпать. Возможно, отсюда - череп.
Черст-/чёрст-?: чёрствый, черстветь.
Черт-/чёрт-: черти, чёрт. Связано с корнем в слове черта или в слове чёрный ?
Черт-/чёрт-: черта, чертить. Связано ли с чёртом?
Чес(н)-: чеснок. Связано ли с чесать и коса (чеснок и лук заплетают в "косы")?
Чест-: честь, честный. Связано с чтить (и чистый?).
Чиж-: птица чиж.
Чин-: чинить, чин, чиновник, чинный.
Чир-: чирей. В этом же гнезде - чиркать?
Чист-/чищ-: чистый, чище; честь. Связано с чтить и честь?
Чит-/чт-/чёт-: почитать, чтить, почёт; честь, честный. Связано с чтить и чистый?
Чит-/чт-: читать, чтение. Связано с чтить и чистый?
Чит-/чёт-//чис(л)-: считать; счёт, число. Также - чётный; чёткий?
Связано с чтить и чистый?
Чит-/чт-/чёт-: почитать, чтить, почёт. Связано с чтить, читать и чистый?
Член-: член.
Чу-: чутьё, чуткий; чуять; чувство, чувствовать.
Чуб-: чуб, чубатый.
Чуд-: чудо, чудеса, чудесный, чудить. Вариант корня куд- (кудесник).
Чуж-: чужой, чужбина. Возможно, от чудный [?].
Чум-: чума, очумелый. Мог быть глагол чумить. Возможно, связано с кум [?].
Чур-: чур, чураться. Чур, первоначально - "предок, дух предка".
Чуш-: чушь.
: . ?
В этот список не вошли корни слов с пока неясной этимологией (многие - иностранные):
чай, чача; чепуха; чувак, чугун, чухнуть, чушка.
И звукоподражательные слова: чирикать; чиркать; чихать; чокаться, чокнутый.
Разобраться
Слова или корни под вопросом (делятся ли на морфемы, можно ли выделить новые суффиксы,
слова исконные или заимствованные и др.).
Возможно, этимологически родственные слова:
чарка, черпать [и череп?];
челядь, чело, человек, член;
Этимологически неясные слова (и возможные заимствования, в т.ч.
общеславянские):